一些創(chuàng)業(yè)板公司的股權(quán)激勵計劃因為行權(quán)門檻低、激勵方案覆蓋范圍廣以及行權(quán)價格低 ，備受市場質(zhì)疑另一方面，在創(chuàng)業(yè)板開板初期，由于市場追捧導(dǎo)致企業(yè)有意識地將行權(quán)價設(shè)定于高位之上，但在如今行情低迷 ，市場回歸理性 ，泡沫減小 ，使得行權(quán)價與當(dāng)下的股價出現(xiàn)集體倒掛的現(xiàn)象。迄今為止，“金手銬”在創(chuàng)業(yè)板上效果差強(qiáng)人意。
1、股權(quán)激勵的實施模式過于單一。
實施股權(quán)激勵的主要形式有股票期權(quán)、限制性股票、股票增值權(quán) 、虛擬股票、業(yè)績股票、經(jīng)營者持股、管理層收購、延期支付計劃、復(fù)合型、業(yè)績單位等。就目前的創(chuàng)業(yè)板上市公司的實施實踐來看，實施股權(quán)激勵的形式過于單一 ，很多創(chuàng)業(yè)板上市公司實施股權(quán)激勵都選擇用限制性股票和股票期權(quán)這兩種方式。
2、監(jiān)管機(jī)制和約束機(jī)制不完善。
許多實施股權(quán)激勵的創(chuàng)業(yè)板企業(yè)都是民營企業(yè)，這些企業(yè)上市后急于選擇實施股權(quán)激勵，使其股權(quán)激勵的自主眭受到嚴(yán)重的制約。國有企業(yè)在股權(quán)激勵中形成的一些監(jiān)管制度，不適合民營企業(yè)，使民營企業(yè)在實施股權(quán)激勵時受到限制。股權(quán)激勵的約束機(jī)制存在一些不足。公司的股權(quán)激勵措施實施是離不開一個良好的公司治理結(jié)構(gòu)，目前，創(chuàng)業(yè)板上市公司股權(quán)激勵在監(jiān)督約束方面仍存在一些問題，一些公司在制定相應(yīng)的激勵條件的時候都是流于形式，都是考慮如何使 自身利益最大化，制定的激勵條件非常低，這樣制訂的股權(quán)激勵計劃是達(dá)不到促進(jìn)上市公司長期發(fā)展，只是很多公司管理者獲取短期利益的一個工具。
3、業(yè)績評價過于單一，評價體系不完善。
目前創(chuàng)業(yè)板上市公司業(yè)績指標(biāo)評價過于單一，評價體系也不夠完善。我國目前的業(yè)績指標(biāo)評價大致都集中在凈利潤增長率和凈資產(chǎn)收益率等幾個主要的會計指標(biāo)上，這其中又主要以凈利潤增長率為主，使用的指標(biāo)過于傳統(tǒng) ，不能夠全面地反映公司管理者對于公司現(xiàn)有的業(yè)績所做出的貢獻(xiàn)。
4、資本市場的有效性影響到制度的實施。
在創(chuàng)業(yè)板開板初期 ，由于市場的追捧導(dǎo)致“三高”嚴(yán)重，在當(dāng)時熱烈的市場氣氛之下 ，一些公司將行權(quán)價格定得較高。企業(yè)推出股權(quán)激勵計劃時，為了與當(dāng)時的市場行情和業(yè)績 目標(biāo)相匹配 ，有意識地將行權(quán)價設(shè)定在高位之上。在市場情緒的助推下，行權(quán)條件的設(shè)置不一定符合企業(yè)的真實情況。因此，當(dāng)市場逐漸回歸理性、泡沫慢慢縮小之后，原本看似近在咫尺的行權(quán)條件，突然變得遙不可及。中國資本市場股價波動和企業(yè)經(jīng)營業(yè)績并非完全相關(guān) ，還有許多影響股價的非市場因素 ，在某些條件下和某個時期內(nèi)甚至是主要影響因素。這使行權(quán)價格的確定和股票期權(quán)的考核無法采用股價作為客觀依據(jù)。
5、管理層存在道德風(fēng)險。
股權(quán)激勵的道德風(fēng)險主要表現(xiàn)在：經(jīng)營者操作發(fā)布虛假信息;經(jīng)營者蓄意進(jìn)行錯誤的投資決策，以獲得巨額的股權(quán)收益 ;經(jīng)營者濫用籌資、股利分配政策操縱股價。股票期權(quán)容易引起高級管理人員的短期行為與會計舞弊。許多創(chuàng)業(yè)板上市公司在設(shè)計股權(quán)激勵制度時，往往以單純的某些財務(wù)指標(biāo)作為衡量業(yè)績發(fā)展的指標(biāo)。業(yè)績評價制度設(shè)計的不完善及短期效應(yīng)性，難免會使得某些高管人員為了行權(quán)而操縱市場的行為。